Curated Public Data

genevestigator를 개발한 NEBION은 다양한 Public repository와 Collection의 고품질 omics 데이터 세트를 선별하고 통합합니다. 
지금까지 275,000건이 넘는 생물학 샘플을 이미 Curation 하였습니다.

Repositories : GEO, ArrayExpress, SERA, dbGAP, etc.
Collections : TCGA, CCLE, Drug Matrix, CMAP, LINCSS, etc.

Therapeutic Areas

Red Biology

이 데이터는 제약 및 생명공학 회사, 영양 및 화장품, 그리고 응용 및 기초 학술 연구에 활용할 수 있습니다. QC, 표준화 및 curation된 Microarray 및 RNA-seq의 200,000개 이상의 샘플은
500개 이상의 조직 / 세포유형, 1500개의 세포주, 700개의 암 유형 및 15,000개 이상의 실험 조건에 대한 정보를 제공합니다.

Species

– Oncology and hematology

– Immunology and rheumatology

– Respiratory diseases

– Cardiovascular diseases

– Endocrinology and metabolism

– Dermatology

– Neurodegenerative diseases

– Pharmacology and toxicology

Green biology

10년이 넘는 시간동안 NEBION의 Biocurator팀은 다양한 실험 환경과 종의 데이터를 수집하고 Curation 및 통합하였습니다.

Species

– Model plants: Arabidopsis and Medicago

– Monocot crops: Maize, rice, wheat, barley, sorghum

– Dicot crops: Soybean, tomato, tobacco

– Organs, tissues and cell types

– Genotypes and knock-outs

– Chemical and hormonal treatments

– Biotic and abiotic stresses

– Hormonal treatments

– Stages of development

– Circadian rythm

– Nutrition

White biology

현재 Curation 된 데이터는 두 모델종 Escherichia coli 와 Saccharomyces cerevisiae에서 이용이 가능합니다.

– Cell cycle studies

– Culture conditions

– Knock-out lines