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전사체 분석

NGS 분석 서비스

전사체 분석은

NGS 기반의 RNA sequencing 또는 Microarray 방식을 통해 설계한 실험 전 후 시점의 활성된 유전자의 발현량을 정량화 및 기능적인 분석을 할 수 있습니다. Illumina Platform 기반으로 고객님의 시료에서 부터 데이터 생산, 분석까지 제공합니다.

쓰리빅스의 전사체 분석 서비스는

최신 분석도구와 유전체 데이터 활용

최신 공공 데이터베이스와 최적화된 분석 파이프라인을 활용하여 원시 데이터를 빠르게 분석합니다.

기초 분석결과와 시각화 자료 제공

원시 데이터의 신뢰도와 품질을 확인하고, 시각화 데이터를 바로 다운로드 할 수 있도록 지원합니다.

유전자의 발현차이를 쉽고 빠르게 검색

관심있는 유전자를 검색을 통해 서로 다른 조건에서 어떻게 발현되는지 쉽게 확인할 수 있습니다.

서비스 상세 내역

  • Standard Analysis

    Data Filtering
    Assessment of Sequencing
    Differentially Expressed Gene (DEG) Analysis
    Gene Ontology Analysis (GO)

  • Advanced Analysis

    Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)
    Gene network analysis by KEGG

시료 요구사항

Sample Type Amount Volume Quality
totalRNA
≥ 1.0ug
≥ 20ul
RIN ≥ 7, RNA ratio > 1.5

* 전사체 분석은 시료에서의 totalRNA 추출 서비스도 함께 하고 있으며, 시료 준비단계에서 궁금하신게 있으시면 연락하여 주시기 바랍니다.
* RIN (RNA Intergrity Number Value)

쓰리빅스는 전사체 분석 시, Illumina Novaseq 6000 Platform 사용을 권장합니다.
인간, 식물, 동물 등 다양한 실험 대상을 바탕으로 제공되는 분석결과는 변동될 수 있습니다.

Platform Type Read Length Data output 비고
Illumina Novaseq 6000
Paired-end 150bp
≥ 6GB
실험 대상에 따라 데이터 생산량은 다를 수 있음

서비스 워크플로우

1. 분석 의뢰 요청

홈페이지에 ‘문의하기’로 분석의뢰 내용을 발송해주시면 분석 담당자가 상담을 도와드립니다.

2. 샘플 발송

분석할 샘플을 드라이아이스 또는 냉장 포장하여  발송하시면 담당자가 확인 후 연락 드립니다.

3. 퀄리티 체크

보내주신 샘플의 분석 가능한지 여부를 확인한 후 보고서 형태로 QC 결과를 보내드립니다.
: 1-2주 소요

4. 시퀀싱

QC를 통과한 샘플은 라이브러리 제작 단계를 거쳐 NGS 장비를 이용하여 원시데이터를 생산합니다.
: 2-3주 소요

5. 데이터 분석

시퀀싱 완료된 원시 데이터를 자체 구축한 분석 파이프라인을 이용하여 분석 진행합니다.
: 1-2주 소요

6. 분석 결과 발송

분석 결과를 HTML 파일 형태로 보고서화 하여 이메일로 발송합니다.

7. 결과 논의

분석 결과에 대해 고객님과  1:1 상담을 진행하여 결과값에 대한 해석을 지원합니다.

8. 결제

분석 완료된 건에 대해 전자세금계산서 또는 카드 결제를 진행합니다.

최종 분석 결과 제공

 약 4-5주 소요

* 샘플 발송 및 포장 안내

발송해 주실 샘플은 드라이아이스를 넣어 냉동 포장발송 (-20℃ 이하)을 권장합니다. 편의점 택배 또는 우체국 택배를 이용하실 때는, 드라이아이스가 모두 기화되지 않도록 당일 발송 가능 여부를 확인하여 발송해주시기 바랍니다.

포장 방법 :

스티로폼 박스 내 드라이아이스(권장 무게 : 5kg 이상)를 넣으신 후,  샘플을 튜브렉 또는 완충재를 이용하여  포장하여 주시기 바랍니다.
(드라이아이스와 샘플이 충돌하면서 튜브나 조직이 손상되는 경우가 많습니다, 꼭 유의하여 주시기 바랍니다)

쓰리빅스 주소 및 수령인  :

경기도 수원시 영통구 광교로 156 (이의동, 광교비즈니스센터) 1403호
이현배 매니저, 031-8064-1877 

쓰리빅스는 자체구축한 분석 파이프라인을 통해
구체적이고 정확한 분석결과를 제공합니다