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마이크로바이옴 분석

NGS 서비스

서비스 개요

마이크로바이옴 분석은 (Microbiome analysis) 다양한 환경에 서식하는 미생물 종을 식별하고 구별하는 방법입니다.  종을 구별할 수 있는 특정 유전자 서열을 이용하여 박테리아, 고세균, 그리고 곰팡이의 분포를 확인할 수 있습니다.  분석 결과를 통해 특정 환경에서 서식하는 미생물균총을 확인하고 이들의 상호작용 및 역할을 확인할 수 있습니다. 쓰리빅스는 NGS (Next Generation Sequencing) 기반으로 생산된 원시 데이터를 최신의 공공 데이터베이스를 이용하여 최적의 분석결과를 제공합니다.

환경에 따른 미생물균총 분석

장내 미생물균총 분석, 피부 미생물 분석, 특정 질병에 대한 조직내 서식하는 미생물균총 분석, 유산균 분석, 
해수 또는 물, 토양 미생물균총 분석, 구강 미생물균총 분석, 제품내에 존재하는 미생물균총 분석…

쓰리빅스 마이크로바이옴 서비스

다양한 시각화된 분석결과 제공

지금까지 다양한 정부기관과 대기업과의 협업으로 유의한 결과값을 도출한 이력이 있습니다. 필요에 맞는 분석결과 자료를 제공합니다.

분석 보고서 가이드북 제공

연구원분들이 쉽게 분석결과를  이해할 수 있도록, 각 분석결과에 대한 가이드북과 튜토리얼을 준비하였습니다. 

최적화된 분석 파이프라인 보유

최신 공공 데이터베이스와 쓰리빅스의 데이터정제 기술을 바탕으로, 생산된 원시 데이터를 빠르고 정확하게 분석합니다.

분석결과 예시 자료

서비스 상세 내역

  • Standard Analysis

    • Taxonomy Annotation
    • Alpha Diversity
    • Beta Diversity
    • Heatmap

  • Functional Analysis

    • Functional Profile
    • STAMP Analysis

  • Advanced Analysis

    • Multivariate
    • Univariate
    • LEfSe
    • Core Microbiome
    • STAMP Analysis
    • Krona Chart
    • Phylogenetic Tree
    • and more

시료 요구사항

Sample Type Amount Volume Purity
Genomic DNA
≥ 200ng
≥ 10μL
OD260/280=1.8-2.0

* 마이크로바이옴 분석은 토양, 분변 등 환경 시료에서의  gDNA 추출 서비스도 함께 하고 있으며, 시료 준비단계에서 궁금하신게 있으시면 연락하여 주시기 바랍니다.

쓰리빅스는 마이크로바이옴 분석 시, Illumina Miseq Platform 활용을 권장합니다.
또한, 5만 이상의 리드값을 생산하여 데이터의 정확도를 높이고, 연구자분들의 연구에 따라 16S-rRNA region을 안내드립니다.

Platform Type Read Length Read Depth Region
Illumina Miseq
Paired-end 300bp
≥ 50,000
V1-V3, V3-V4, ITS2

서비스 워크플로우

1. 분석 의뢰 요청

홈페이지에 ‘문의하기’로 분석의뢰 내용을 발송해 주시면 분석 담당자가 상담을 도와드립니다.

2. 샘플 발송

분석할 샘플을 드라이아이스 또는 냉장 포장하여 당사로 발송하시면 담당자가 확인 후 연락을 드립니다.

3. 퀄리티 체크

보내주신 샘플의 16S-rRNA의 특정 Region을 확인하는 QC과정 후, 분석 가능한지 여부를 확인한 후 보고서 형태로 보내드립니다.
: 1-2주 소요

4. 시퀀싱

QC를 통과한 샘플은 라이브러리 제작 단계를 거쳐 NGS 장비를 이용하여 시퀀싱 및 원시데이터를 생산합니다.
: 2-3주 소요

5. 데이터 분석

시퀀싱 완료된 원시 데이터를 자체 구축한 분석 파이프라인을 이용하여 분석 진행합니다.
: 일주일 소요

6. 분석 결과 발송

분석 결과를 HTML 파일 형태로 보고서화 하여 이메일로 발송합니다.

7. 결과 논의

분석 결과에 대해 고객님과  1:1 상담을 진행하여 결과값에 대한 해석을 지원합니다.

8. 결제

분석 완료된 건에 대해 전자세금계산서 또는 카드 결제를 진행합니다.

최종 분석 결과 제공

 약 3-4주 소요

쓰리빅스는 자체구축한 분석 파이프라인을 통해
구체적이고 정확한 분석결과를 제공합니다