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전사체 분석

NGS 서비스

서비스 개요

마이크로바이옴 분석은 (Microbiome analysis) 다양한 환경에 서식하는 미생물 종을 식별하고 구별하는 방법입니다.  종을 구별할 수 있는 특정 유전자 서열을 이용하여 박테리아, 고세균, 그리고 곰팡이의 분포를 확인할 수 있습니다.  분석 결과를 통해 특정 환경에서 서식하는 미생물균총을 확인하고 이들의 상호작용 및 역할을 확인할 수 있습니다. 쓰리빅스는 NGS (Next Generation Sequencing) 기반으로 생산된 원시 데이터를 최신의 공공 데이터베이스를 이용하여 최적의 분석결과를 제공합니다.

환경에 따른 미생물균총 분석

장내 미생물균총 분석, 피부 미생물 분석, 특정 질병에 대한 조직내 서식하는 미생물균총 분석, 유산균 분석, 
해수 또는 물, 토양 미생물균총 분석, 구강 미생물균총 분석, 제품내에 존재하는 미생물균총 분석…

쓰리빅스의 전사체 분석 서비스

최신 분석도구와 유전체 데이터 활용

최신 공공 데이터베이스와 최적화된 분석 파이프라인을 활용하여 원시 데이터를 빠르고 정확하게 분석합니다.

기초 분석결과와 시각화 자료 제공

원시 데이터의 신뢰도와 품질을 확인하고, 원하는 시각화 데이터를 바로 다운로드 할 수 있도록 지원합니다.

유전자의 발현차이를 쉽고 빠르게 검색

관심있는 유전자가 간단한 검색을 통해 서로 다른 조건에서 어떻게 발현되는지 쉽게 확인할 수 있습니다.

분석결과 예시 자료

서비스 상세 내역

  • Standard Analysis

    • Taxonomy Annotation
    • Alpha Diversity
    • Beta Diversity
    • Heatmap

  • Functional Analysis

    • Functional Profile
    • STAMP Analysis

  • Advanced Analysis

    • Multivariate
    • Univariate
    • LEfSe
    • Core Microbiome
    • STAMP Analysis
    • Krona Chart
    • Phylogenetic Tree
    • and more

시료 요구사항

Sample Type Amount Volume Purity
Genomic DNA
≥ 200ng
≥ 10μL
OD260/280=1.8-2.0

* 마이크로바이옴 분석은 토양, 분변 등 환경 시료에서의  gDNA 추출 서비스도 함께 하고 있으며, 시료 준비단계에서 궁금하신게 있으시면 연락하여 주시기 바랍니다.

쓰리빅스는 전사체 분석 시, Illumina Novaseq 6000 Platform 사용을 권장합니다.
인간, 식물, 동물 등 다양한 실험 대상을 바탕으로 제공되는 분석결과는 변동될 수 있습니다.

Platform Type Read Length Data output 비고
Illumina Novaseq 6000
Paired-end 150bp
≥ 6GB
실험 대상에 따라 데이터 생산량은 다를 수 있음

서비스 워크플로우

1. 분석 의뢰 요청

홈페이지에 ‘문의하기’로 분석의뢰 내용을 발송해 주시면 분석 담당자가 상담을 도와드립니다.

2. 샘플 발송

분석할 샘플을 드라이아이스 또는 냉장 포장하여 당사로 발송하시면 담당자가 확인 후 연락을 드립니다.

3. 퀄리티 체크

보내주신 샘플의 16S-rRNA의 특정 Region을 확인하는 QC과정 후, 분석 가능한지 여부를 확인한 후 보고서 형태로 보내드립니다.
: 1-2주 소요

4. 시퀀싱

QC를 통과한 샘플은 라이브러리 제작 단계를 거쳐 NGS 장비를 이용하여 시퀀싱 및 원시데이터를 생산합니다.
: 2-3주 소요

5. 데이터 분석

시퀀싱 완료된 원시 데이터를 자체 구축한 분석 파이프라인을 이용하여 분석 진행합니다.
: 일주일 소요

6. 분석 결과 발송

분석 결과를 HTML 파일 형태로 보고서화 하여 이메일로 발송합니다.

7. 결과 논의

분석 결과에 대해 고객님과  1:1 상담을 진행하여 결과값에 대한 해석을 지원합니다.

8. 결제

분석 완료된 건에 대해 전자세금계산서 또는 카드 결제를 진행합니다.

최종 분석 결과 제공

 약 3-4주 소요

쓰리빅스는 자체구축한 분석 파이프라인을 통해
구체적이고 정확한 분석결과를 제공합니다